Η Νίκη Λευκάδας ιδρύθηκε στις 6 Δεκεμβρίου 2006 (ανήμερα της εορτής της), αρχικά ως κομμάτι της Δόξας Λευκάδας και κατόπιν ως ανεξάρτητο σωματείο. Μετά από τρία χρόνια πρωταθλημάτων στην ΕΣΚΑΒΔΕ, το 2009 ήρθε η ώρα της ανόδου στην Α2. Από το 2009 έως και το 2012 ο σύλλογος έπαιρνε μέρος στο πρωτάθλημα ως μέλος του ομίλου του Νότου, ενώ από τη σεζόν 2012-13 έως και το 2014-15 συμμετείχε στον όμιλο του Βορρά. Η τελευταία σεζόν που η Νίκη αγωνίστηκε στην Α2, ήταν και η πλέον επιτυχημένη για το Σωματείο στην 9ετή ιστορία του, αφού κατέκτησε το πρωτάθλημα αήττητη, με 22 νίκες σε ισάριθμα ματς, πανηγυρίζοντας την άνοδο στην Α1.
Η εξαιρετική αυτή παρουσία της ομάδας ήταν η καλύτερη παρακαταθήκη για την παρθενική εμφάνιση στη μεγάλη κατηγορία. Αγωνιστικότητα, πάθος και προσεγμένες επιλογές οδήγησαν την ομάδα μας στην έκτη θέση της Α1 τη σεζόν 2015-16 σε μια άκρως επιτυχημένη χρονιά στην Α1 στα παρκέ της κορυφαίας κατηγορίας του γυναικείου μπάσκετ της χώρας μας.
Tην αγωνιστική περίοδο 2016-17 η ομάδα των Γυναικών μας προκρίθηκε στο Final Four του Κυπέλλου μετά από τη μεγαλειώδη νίκη της επί του Παναθηναϊκού στα προημιτελικά. Στον ημιτελικό ηττήθηκε από τον Πανιώνιο, κατέκτησε την τρίτη θέση του θεσμού μετά τη νίκη επί του Πρωτέα Βούλας στον μικρό τελικό. Στην Α1 τερμάτισε στην πέμπτη θέση πετυχαίνοντας 13 νίκες, ενώ ηττήθηκε 9 φορές.
Τη σεζόν 2017-18 η ομάδα μας τερμάτισε επίσης στην πέμπτη θέση της Α1 με 12 νίκες και 10 ήττες. Αξιοσημείωτο της σεζόν η εκπληκτική νίκη της ομάδας κόντρα στη Δάφνη Αγίου Δημητρίου μετά από έξι παρατάσεις (109-106) ενώ πρέπει να αναφερθεί και η κλήση της Έλενας Τσινέκε στην Εθνική Γυναικών, ως η πρώτη αθλήτρια του Συλλόγου μας που κλήθηκε στο αντιπροσωπευτικό μας συγκρότημα.
Κατά τη σεζόν 2018-19 η ομάδα μας δήλωσε συμμετοχή στο Ευρωπαϊκό Κύπελλο (EuroCup Women). Η Νίκη Λευκάδας αποτέλεσε την πρώτη ομάδα των Επτανήσων που συμμετέχει σε επίσημη διεθνή διοργάνωση. Στην προκριματική φάση της διοργάνωσης πήρε μια σπουδαία πρόκριση επί της ρωσικής Spartak Noginsk, ενώ στον όμιλο αντιμετώπισε ευρωπαϊκά μεγαθήρια, μεταξύ αυτών και την Κυπελλούχο Ευρώπης Galatasaray και όπως ήταν αναμενόμενο αποκλείστηκε. Παράλληλα προκρίθηκε στον τελικό του Κυπέλλου Ελλάδας μετά τη νίκη της επί της Δάφνης Αγίου Δημητρίου στον συναρπαστικό ημιτελικό των Χανίων με σκορ 73-68. Στον μεγάλο τελικό ηττήθηκε από τον Ολυμπιακό με σκορ 78-69 και κατέκτησε τη δεύτερη θέση και το ασημένιο μετάλλιο. Στην Α1 τερμάτισε στην τέταρτη θέση, την υψηλότερη στην ιστορία της, ενώ τη σεζόν 2019-20 κατετάγη έκτη.
Προπονητές της Γυναικείας Ομάδας: Θωμάς Ζαβιτσάνος (2006-2011), Θοδωρής Πολυμένης (2011-2012), Νίκος Δουβίτσας (2012-2019), Θωμάς Ζαβιτσάνος (2020-)
Αξίζει να αναφερθεί ότι το Σωματείο της Νίκης Λευκάδας στηρίζεται οικονομικά κυρίως σε οικονομικούς παράγοντες και φορείς του νησιού, κατά βάση μικρομεσαίες επιχειρήσεις της τοπικής κοινωνίας. Με έδρα το Κλειστό Γυμναστήριο του Δήμου Λευκάδας, χωρητικότητας 1200 θέσεων φιλοδοξεί να δημιουργήσει τη δικιά του «παραγωγή» ταλέντων, καθώς διαθέτει τμήματα Νεανίδων, Κορασίδων, Παγκορασίδων που πρωταγωνιστούν στα πρωταθλήματα της ΕΣΚΑΒΕ, απασχολώντας συνολικά περίπου 100 νεαρά κορίτσια.
